综合LZ说的几点，可以肯定是印刷厂的问题。
1、之前印刷厂出了2次菲林，证明是印刷机打样的。
2、打样颜色通过，但是大货颜色有色差，在于印刷操作人员过程控制问题。
3、LZ需要证明的是打样你认为颜色通过了是否有签字？
4、打样的纸张和大货的纸张是否一致？
如果打样你签字了，纸张也一样，那么LZ可以理直气壮的说就是印刷问题，不管他们什么借口，都是没有按照你的签字样来印刷，责任在于印刷厂，完全可以要求重新印刷或者拒收大货。如果在合同上注明了颜色不符合要求有权拒收或要求重新印刷，那么你完全不需要跟印刷厂做太多无用的说法。